“三证合一”后，纳税人识别号是纳税人、扣缴义务人被赋予全国唯一的纳税识别代码。已取得统一社会信用代码的法人和其他组织，其纳税人识别号直接使用18位的“统一社会信用代码”。以统一社会信用代码、身份证等为有效身份证明的临时纳税人，其纳税人识别号由“L”+“统一社会信用代码”或“L”+“身份证件号码”组成。
未取得统一社会信用代码的个体工商户以及以居民身份证等有效身份证明办理税务登记的纳税人，其纳税人识别号仍然由“身份证件号码”+“2位顺序码”组成。“三证合一、一照一码”登记制度改革前已设立但未取得统一社会信用代码的法人和其他组织，以及自然人等其他各类纳税人，其纳税人识别号的编码规则仍按原来规定执行。这样减少了对已登记纳税人的影响和负担，保证了未取得统一社会信用代码的纳税人正常办理涉税事项。
